杜红丽,1975年11月生于湖南省,汉族女性,博士学位持有者,现任华南理工大学生物科学与工程学院教授。她主要负责教授《生物化学》《分子生物学》和《系统生物学》等课程。
个人履历
1995.9-1999.7:华南农业大学 畜牧 学士
1999.9-2002.7:华南农业大学 动物遗传育种 硕士
2002.9-2005.7:华南农业大学 动物遗传育种 博士
2003.8-2003.10:华中农业大学动物遗传国家重点实验室学习基因组相关技术
2006.1-2009.8 华南理工大学 讲师
2006.5-2006.8 中国医学科学院生物技术研究所进修
2009.9-2015.8 华南理工大学 副教授
2015.9-至今 华南理工大学 教授
科研方向
博士期间利用比较基因组学将21个功能基因定位在猪繁殖性状的QTL区间。2006年1月至2009年8月,主要从事工业酶理性设计和改造研究,通过蛋白质结构生物信息学全理性设计将木糖还原酶依赖的辅酶从NADP改成NAD。2009年9月定职为华南理工大学副教授,主要从事功能基因组学和生物信息学的研究。参与了华南新药创制中心、华大、华南理工大学等单位合作的食蟹猕猴和中国猕猴基因组项目,并以重要作者身份在《Nature Biotechnology》发表论文。迄今为止,共发表论文40余篇,其中SCI论文20余篇。参与编写《食品与基因工程》论著,3.5万字。主持或完成了2项国家级、2项省级、1项市级和3项校级科研项目,参与了多项国家自然科学基金和863项目。主讲《生物化学》、《分子生物学》、《系统生物学》等课程。
研究兴趣
(1)重大疾病潜在生物标志物和靶标研究:随着组学技术的快速发展,国际积累了海量的组学数据,利用交叉学科的思维和系统生物学方法从各个层次去揭示疾病发病机制,鉴定其潜在的生物标志物和靶标,课题组目前主要在2型糖尿病和结核感染等方面开展研究工作;
(2)高通量基因组技术在疾病预测预防中的应用:利用高通量组学技术在重大老年病及肿瘤的预测、预防上做些前瞻性的研究。
主持项目
1.主持广东省自然科学基金:木糖还原酶和木糖醇脱氢酶定向分子进化研究(2006-2009)
2.参与国家“863”项目:药物代谢酶SNPs与药物的类药性一体化预测软件的研究与开发(2008-2011)
3.主持广东省科技计划项目:食蟹猴免疫和疾病相关基因库及MHC等位基因信息库的建立(2010-2012)
4.主持华南理工大学中央高校基本科研业务费重点项目:食蟹猕猴2型糖尿病模型构建的遗传标记研究(2011-2012)
5.十二五重大专项(副组长):人类重大疾病灵长目模型资源平台的建设(2011-2013)
6.主持广东省科技计划项目:食蟹猴2型糖尿病模型构建和评价体系的建立和完善(2012-2013)
7.主持华大华工创新基金:2型糖尿病发病进程中的分子机制和干预治疗的靶标筛查研究(2013-2015)
8.主持国家自然科学基金:食蟹猴2型糖尿病模型发病进程的分子机制研究(2014)
9.参与国家自然科学重点基金:金属矿区硫素生物地球化学循环过程中的关键问题(2014-2018)
10.参与科技支撑项目:灵长目人类重大疾病模型的研究与示范(2014-2016)
11.参与科技支撑项目:实验动物感染病原的MFIA、PCR-HRM、基因芯片检测诊断和遗传质量SNP检测的新技术方法研究和应用(2015-2017)
发表论文
1.Li Y, Zheng H, Luo R, Wu H, Zhu H, Li R, Cao H, Wu B, Huang S, Shao H, Ma H,Zhang F, Feng S, Zhang W, Du H, Tian G, Li J, Zhang X, Li S, Bolund L,Kristiansen K, de Smith AJ, Blakemore AI, Coin LJ, Yang H, Wang J, Wang J. Structural variation in two human genomes mapped at single-nucleotide resolution by whole genome de novo assembly.Nature Biotechnology. 2011,29(8):723-730(SCI IF=31.1)
2.Yan G, Zhang G, Fang X, Zhang Y, Li C, Ling F, Cooper DN, Li Q, Li Y, Van Gool AJ, Du H, Chen J, Chen R, Zhang P, Huang Z, Thompson JR, Meng Y, Bai Y, Wang J, Zhuo M, Wang T, Huang Y, Wei L, Li J, Wang Z, Hu H, Yang P, Le L, Stenson PD, Li B, Liu X, Ball EV, An N, Huang Q, Zhang Y, Fan W, Zhang X, Li Y, Wang W, Katze MG, Su B, Nielsen R, Yang H, Wang J, Wang X, Wang J. Genome sequencing and comparison of two nonhuman 灵长目 动物界 models, the cynomolgus and Chinese rhesus macaques.Nature Biotechnology. 2011, 29(11):1019-23.(SCI IF=31.1)
3.Du H, Hu H, Meng Y, Zheng W, Ling F, Wang J, Zhang X, Nie Q, Wang X. The correlation coefficient of GC content of the genome-wide genes is positively correlated with 动物界 evolutionary relationships. FEBS Letter. 2010, 584(18):3990-4(SCI IF=3.5)
4.Du HL, Chen J, Cui JX, Wang XN and Zhang XQ. Polymorphisms on SSC15q21-q26 containing QTL for reproduction in swine and its association with litter size. Genetics and Molecular Biology, 2009, 32(1):69-74(SCI)
5.Du HL, Chen J, Zhang YS, Zhang XQ Molecular cloning, mapping, and polymorphism of the porcine SCG2 gene. Biochem Genet, 2008, 46 (3): 369-379.(SCI)
6.Du HL, Chen J, Cui JX, Zhang YS, Yerle M, Milan D, Zhang XQ. Radiation hybrid mapping and sequence analysis of 21 genes on porcine chromosome 15. Anim Genet, 2006, 37(2):181-183.(SCI IF=2.6)
7.Zeng QK, Du HL(并列第一),Wang JF, Wei DQ, Wang XN, Li YX, Lin Y. Reversal of Coenzyme Specificity and Improvement of 催化 Efficiency of 毕赤酵母属 Stipitis Xylose 还原酶 by the Rational Site-directed Mutagenesis. Biotechnol Lett. 2009, 31(7):1025-9(SCI)
8.Fang M, Du H, Hu Y, Zhou X, Ouyang H, Zhang W, Jia X, Li J, Wang Y, Nie Q, Zhang X. Identification and Characterization of the Pig ABIN-1 Gene and Investigation of its Association with Reproduction Traits. J Genetic. 2011, 90(1):e10-20
9.Zhang YS, Du HL, Chen J, Yang GF, Zhang XQ. Porcine growth differentiation factor 9 gene polymorphisms and their associations with litter size. J Genet Genomics, 2008, 35 (3): 163-169.(SCI)
10.Cui JX, Du HL, Liang Y, Deng XM, Li N, Zhang XQ. Association of Polymorphisms in the 助催化剂 Region of 鸡肉 Prolactin with Egg Production.Poultry science. 2006, 85(1):26-31.(SCI Impact Factor=2.1)
11.Zhen FS, Du HL, Xu HP, Luo QB, Zhang XQ. Tissue and allelic-specific expression of hsp70 gene in chickens: basal and heat-stress-induced mRNA level quantified with real-时间 reverse transcriptase polymerase chain reaction. British Poultry science. 2006, 47(4):449-455.(SCI Impact Factor=1.3)
12.Jin X, He M, Ferguson B, Meng Y, Ouyang L, Ren J, Mailund T, Sun F, Sun L, Shen J, Zhuo M, Song L, Wang J, Ling F, Zhu Y, Hvilsom C, Siegismund H, Liu X, Gong Z, Ji F, Wang X, Liu B, Zhang Y, Hou J, Wang J, Zhao H, Wang Y, Fang X, Zhang G, Wang J, Zhang X, Schierup MH, Du H, Wang J, Wang X. An effort to use human-based exome capture methods to analyze chimpanzee and macaque exomes. PLoS One. 2012;7(7):e40637.通讯作者(SCI IF=4.0)
13.Chen J, Meng Y, Zhou J, Zhuo M, Ling F, Zhang Y, Du H, Wang X. Identifyingcandidate genes for Type 2 糖尿病 Mellitus and 肥胖症 through gene expression profiling in multiple tissues or cells. J Diabetes Res. 2013, 2013:970435. doi:10.1155/2013/970435.通讯作者(SCI IF=3.5)
14.Zhou J et al. ComparativeMicroRNA Expression Profiles of Cynomolgus Monkeys, Rat and Human Reveal miR-182Involved in T2D Pathogenic Processes. J Diabetes Res.2014,2014:760397通讯作者(SCI IF=3.5)
15.Wang Y, et al. Identifying Human Genome-wide CNV, LOH and UPD by Targeted Sequencing of Selected Regions.PLoS One.2015, 10(4):e0123081通讯作者
16.Meng Y, et al. Genome-wide Analysis of Positively Selected Genes in Seasonal and Non-seasonal Breeding 物种PLoS One.2015, 10(5):e0126736通讯作者
17.Chen B, et al. A Genome-Wide mRNA Screen and Functional Analysis Reveal FOX臭氧 as a Candidate Gene for 鸡肉 Growth. PLoS One. 2015, 10(9):e0137087.通讯作者
18.杜红丽,王靖方,曾琦,凌飞,魏冬青,林影,王小宁.木糖还原酶定点突变设计的生物信息学分析.华南理工大学学报(自然科学版), 2008, 36(12):122-127.
19.杜红丽,崔建勋,张细权.利用脱氧核糖核酸池和测序技术快速筛查候选效应单倍型.农业生物技术学报,2008, 16(2):281-285
20.曾琦锴,林影,翟志臣,林小琼,杜红丽.木糖还原酶Lysine270突变的理性设计.华南理工大学学报(自然科学版), 2009,37(6):79-83(通讯作者)
21.郑维豪,杜红丽,林志强,闪莹,王小宁.猪肺泡巨噬细胞感染PRRSV进程中差异表达基因及基因功能富集分析.基因组学与应用生物学,2010,1039-1046(通讯作者)
22.郑维豪,林志强,卓敏,杜红丽,王小宁。抗流感病毒科小RNAs研究进展。遗传2012, 34(5):526―532(通讯作者)
23.中国圈养食蟹猕猴TrimCyp基因频率。田帅,蒙裕欢,柳明玉,孙飞,陈军辉,杜红丽,王小宁.动物学研究 2013,34(2): 97−102(通讯作者)