南京市气象局实行上级气象主管机构与本级人民政府双重领导，以上级气象主管机构领导为主的管理体制，在江苏省气象局和南京市人民政府领导下，根据授权承担本行政区域内气象工作的政府行政管理职能。
机构简介
南京市气象局全面落实科学发展观，树立“三气象”理念、大力实施“三大战略”、争创“四个一流”，解放思想，开拓创新，深化改革，以提高天气预报准确率为核心，加快气象现代化建设，加强气象科技开发与应用，不断拓宽气象业务服务领域，加强气象文化建设，努力推进气象依法行政工作，气象事业呈现蓬勃生机。
南京市气象局业务现代化建设取得长足发展，气象基本业务稳步提高。全市已建成布局合理，分工明确的气象台站网；形成了覆盖全市、观测要素齐全的气象观测系统；初步建立了各种气象灾害的监测网络。
南京市气象局坚持“以人为本、无微不至、无所不在”的气象服务理念，气象服务工作深得社会和政府的满意。在1999—2001年南京八卦洲长江大桥建设中，气象局开展跟踪气象服务800多次。2001年为第六届世界华商大会提供气象服务，市政府授予气象局“华商大会服务有功单位”。2005年三桥铺设桥面的关键时期，提供了逐时温度和湿度预报。2005年精心做好“十运会”和首届中国绿化博览会气象保障服务，分别荣获“十运会保障服务贡献奖”和首届中国绿化博览会先进集体。
主要职责
1.制定本行政区域气象事业发展规划、计划，并组织实施；对本行政区域内的气象活动进行指导、监督和行业管理。
2.组织管理本行政区域内气象灾害防御工作；组织拟订和实施本行政区域
的气象灾害防御规划；组织气象灾害防御应急管理工作；及时提出气象灾害防
御措施，并对重大气象灾害做出评估，为本级人民政府组织气象灾害防御提供
决策依据。
3.管理、指导和组织实施本行政区域人工影响天气工作；指导城乡气象工
作，组织推进农村气象灾害防御体系和农业气象服务体系建设。
4.组织管理本行政区域内雷电灾害防御工作，会同有关部门指导对可能遭
受雷击的建筑物、构筑物和其它设施安装的雷电灾害防护装置的检测工作；负
责管理本行政区域内的施放气球
活动。
5.组织本行政区域内气候资源的综合调查、区划，指导气候资源的开发利
用和保护，组织并审查重点建设工程、重大区域经济开发项目气候资源开发利
用项目和城乡建设规划的气候可行性论证和气象灾害风险评估。
6.负责本行政区域内的气象台站和气象设施的组织建设和运行维护管理；
组织管理本行政区域内气象探测资料的采集、传输和汇交；依法保护气象设施
和探测环境；负责审查建设项目大气环境影响评价所使用的气象资料。
7.负责本行政区域内的气象监测、预报预警、公共服务管理工作；组织管
理本行政区域内气象信息的发布和传播；
组织重大活动、突发公共事件气象保
障工作；承担重大突发公共事件预警信息发布系统建设及运行维护。
8.组织开展气象法制宣传教育，负责监督有关气象法律法规的实施，对违
反《中华人民共和国气象法》等法律法规有关规定的行为依法进行处罚，承担
有关行政复议和行政诉讼；组织宣传、普及气象科学知识。
9.管理本级气象部门内部的计划财务、人事劳动、队伍建设、科研、教育
培训和业务建设；会同区人民政府对所辖区气象机构实施以部门为主的双重管
理，落实公共财政保障工作；会同地方党委和人民政府做好党的建设、精神文
明和气象文化建设。
10.承担上级气象主管机构和本级人民政府交办的其他事项。
内设机构
根据上述主要职能，市气象局内设四个职能处室。
1、办公室
组织协调局机关日常工作；负责文秘、档案、保密、信息等工作；负责安全保卫、固定资产管理、后勤保障和基建管理等工作；负责局机关并指导本系统政务信息、业务宣传、办公自动化管理工作。
2、业务科技处（政策法规处）
负责全市气象业务、气象装备和保障的管理；研究制定有关气象事业的地方性法规、规章和规范性文件；组织有关法规的宣传教育和法规咨询；负责有关行政复议、行政诉讼应诉工作。
3、人事教育处（监察审计处）
负责局机关和直属单位机构编制、人事、劳动工资、职工继续教育等管理工作；负责全市气象系统的行政监察、违法、违纪案件的查处；承办出国(境)人员的审查工作。
4、计划财务处
负责编制全市气象事业发展规划及年度计划并组织实施；负责全市气象部门各项资金的筹集和管理，组织实施部门预算改革和国库集中支付管理工作；负责政府采购、社会保障基金的管理等工作。
参考资料
南京市气象局工作职责.江苏省气象局.2022-08-03